שלוש מלגות הלימודים ימומנו על ידי קרנות שונות שתורמות למכללה. המלגות מיועדות לתושבי קו העימות בצפון הארץ ובדרומה הנמצאים בטווח הטילים, שיירשמו ללימודים באחד מחוגי מכללה ורישומם יאושר עד ליום ראשון 13 באוגוסט 2006.
הכרזה על שלושת הנרשמים הזוכים בהגרלת המלגה תיערך ביום שלישי 15 באוגוסט 2006, במסגרת כנס פרוייקטים של החוג להנדסת חומרים מתקדמים.
המכללה האקדמית להנדסה ירושלים, מתגייסת למען תושבי קו העימות ויוצאת במבצע מיוחד למען הנרשמים לשנת הלימודים הבאה המתגוררים בצפון הארץ ובדרומה. במסגרת המבצע יזכו שלושה מהנרשמים החדשים במימון מלא של שכר הלימוד בשנת הלימודים הראשונה שלהם במכללה. גובה שכר הלימוד הוא אוניברסיטאי.
