בשנת 1986 נפתח המסלול האקדמי הראשון של המכללה למינהל. זו היתה הפעם הראשונה שמוסד שאינו מתוקצב הוסמך ע"י המועצה להשכלה גבוהה להעניק תואר אקדמי מוכר. הראשון שבהם היה התואר בוגר במינהל עסקים. המסלול האקדמי הוא המכללה הגדולה בישראל. לומדים בו כ-9,000 סטודנטים, מהם 1,300 לתואר שני. מעל 20,000 מבוגריו משולבים בהצלחה בחיי המשק והחברה. למסלול האקדמי המכללה למנהל תוכניות פיתוח אקדמיות חדשניות, ותוכניות חדשות לתואר ראשון ושני נמצאות בשלבי אישור ופיתוח שונים. בחסות המסלול האקדמי פועלת גם מכינה קדם-אקדמית.
התפיסה המנחה את המסלול האקדמי היא של שילוב בין לימודים אקדמיים לידע מקצועי יישומי. תפיסה זו, המשתקפת בתחומי הלימוד, באה לידי ביטוי בתוכניות הלימודים הייחודיות, בדרכי ההוראה ובבחירת הסגל האקדמי. הלימודים במסלול האקדמי מעניקים לסטודנטים, בנוסף לידע רחב, גם יכולת ליישמו בתחומי הלימוד ובמגוון רחב של תפקידי ניהול ומחקר יישומי ושימושי.
במסלול האקדמי פועלת רשות הוראה ומחקר, המטפחת את רמת ההוראה בקורסים השונים ופועלת לשיפור וקידום אמצעי הוראה ודרכיה בקרב הסגל; וכן מסייעת ותומכת בפעולות מחקריות הנעשות במסלול האקדמי.
צוות המרצים במסלול האקדמי המכללה למנהל כולל פרופסורים ובעלי תואר דוקטור מן השורה הראשונה, ביניהם כאלה המלמדים גם באוניברסיטאות יוקרתיות בארץ ובחו"ל, וחברי סגל בעלי ניסיון רב בעבודה עם פירמות מובילות בארץ ובעולם, אליהם מצטרפים כמרצים וכאורחים, מומחים בולטים בתחומים אקדמיים ויישומיים.
לרשות הסטודנטים סביבת לימודים חדשניתהכוללת: מעבדות מחשבים וערכות מולטימדיה חדישות, ספריות עדכניות, מאגרי מידע ממוחשבים, דואר אלקטרוני אישי לכל סטודנט, פורטל לימודים מתקדם ובו אתרי הקורסים וחומרי לימוד, מרכזי שירות ומרכזי מידע ממוחשבים הפרושים בכל הקמפוס. הקמפוס הנאה, על מדשאותיו ושביליו, שוקק פעילות סטודנטיאלית ערה.
המסלול האקדמי משתדל לסייע לסטודנטים לכל אורך מסלול לימודיהם ולאחריו: החל בלימודים, המקנים לבוגרים כלים להצלחה בעבודתם; דרך מתן מלגות ותוכנית הלוואות ארוכת טווח; המשך ביחידה להכוון תעסוקתי, המסייעת לסטודנטים לקראת סיום לימודיהם; וכלה בפורום הבוגרים המקיים הרצאות והשתלמויות לבוגרים ודרכו מלווה המסלול האקדמי את הסטודנט גם לאחר סיום לימודיהם.
כיום פועל המסלול האקדמי בשני קמפוסים: הקמפוס בראשון לציון שהוא הקמפוס המרכזי, בו מתנהלות תוכניות הלימודים וקמפוס תל אביב, בו מתקיימים לימודי בית הספר לתקשורת.
