על פי מחקר שהוזמן ע"י משרד החינוך נמצא, כי ציוני הבגרות של תלמידים שנבחנו במועדי ב' גבוהים יותר מהציונים של אלו שנבחנו במועד א'. במחקר נבדקו ציוני התלמידים במתמטיקה ובאנגלית בשני המועדים בשנים 2001-2003.
הסיבה לכך היא אפקט סטטיסטי לפיו מי שנבחן פעמיים באותו מבחן גדלים סיכוייו לקבל ציון הקרוב יותר לאמצע התפלגות הציונים-כלומר ציון גבוה יותר ולא בגלל שיפור הידע. מהמחקר עולה עוד כי מי שמגיע להבחן במועד ב' אינם התלמידים שנכשלו במועד א' ולמענם מיועד מועד ב' אלא תלמידים שפשוט רוצים לשפר את הציון .
המחקר לא מצא הבדלים גדולים ברמת שאלוני המבחן בין שני המועדים אך כן מצא הבדל משמעותי של כ-6 נקודות בממוצע בין שני המועדים. 68% מתוך התלמידים שנבחנו בתשס"ג במתמטיקה במועד ב' השיגו ציון גבוה מזה שהשיגו במועד א'.
שאלה נוספת שמעלה המחקר היא, האם העלייה בשנים האחרונות באחוזי הזכאות לבגרות נובעת משיפור אמיתי ברמת ובידע התלמידים או שהיא מלאכותית ונובעת מהקלות בבחינות או האפשרות לשני מועדים שהונהגה באנגלית ומתמטיקה.