אוניברסיטת חיפה פתחה מסלול אקדמי מיוחד ויוקרתי שבמהלכו יוכשרו חובלים לתואר ראשון. חניכי קורס חובלים ירכשו השכלה אקדמית באוניברסיטה, בד בבד עם רכישת מקצוע קצין הים ויסיימו את מסלול קצין הים כבוגרי תואר ראשון בלימודים רב תחומיים.המחזור הראשון שמתחיל ללמוד לתואר ראשון הוא מחזור קי"ג..
תכנית הלימודים נבנתה עבור החובלים על בסיס מתכונת החוג ללימודים רב תחומיים. התכנית תכלול קורסים במדעי המדינה, בכלכלה ומנהל, בתחבורה וספנות וקורסים כלליים נוספים, כגון טרור ולחימה בטרור ומבוא לבטחון לאומי. הקורסים ינתנו על ידי מרצים מומחים בתחומם. הלימודים יתפרסו על פני שתי שנות לימוד ולצורך כך יתארך קורס החובלים ב- 30 שבועות.
שילוב לימודים אקדמים בקורס חובלים מאפשר להרחיב את השכלתם הכללית של הצוערים, לבנות בסיס ידע רחב בתחומים נדרשים ולשמר את רמתו הגבוהה של קורס החובלים.
פרופ' בן זאב, נשיא האוניברסיטה מציין כי "לאוניברסיטת חיפה היסטוריה ארוכה של שיתוף פעולה עם כוחות הביטחון בהיבטים של תכניות לימודים, קליטת תלמידים והקמת מכוני מחקר בתחום. האוניברסיטה מייחסת חשיבות רבה לשיתוף פעולה עם כוחות הבטחון וגאה להוביל תכנית יוקרתית זו".
במחזור הראשון שיצא לדרך באפריל 2005 לומדים 37 חובלים.