שכר הלימוד באוניברסיטאות עלה ריאלית בכ-15% בעשור האחרון - כך עולה ממחקר של כלכלני בנק הפועלים. רובה של התייקרות זו התרחשה ב-2001-'99. בהשוואה למוסדות חינוך אחרים, כמו גנים, מעונות ובתי ספר היסודי והתיכון, מדובר בעלייה צנועה יחסית.
בסוף אוקטובר החלו הלימודים באוניברסיטאות, אולם רשמית לא מתקיימים לימודים בשל שביתות המרצים שדורשים תוספות שכר. התשלומים עבור הלימודים באוניברסיטאות מהווים כ-1.2% מסל הצריכה המשפחתי.
שכר הלימוד במוסדות האקדמיים מעודכן אחת לשנה, בתחילת שנת הלימודים. באותו מועד מעדכנת הלשכה המרכזית לסטטיסטיקה את המדד לפי העלות בפועל, במועד ההתייקרות בתחילת שנת הלימודים. ביתרת חודשי השנה המדד מועלה לפי שיעור התייקרות מדד המחירים לצרכן בחודש הקודם.
בישראל שי 7 אוניברסיטאות. לצדן פועלות כ-44 מכללות, נכון לנתוני 99', וכן שלוחות של אוניברסיטאות מחו"ל המעניקות בעיקר תואר ראשון. באוניברסיטאות לומדים 57% מהסטודנטים, ו-27% במכללות לסוגיהן ו-16% באוניברסיטה הפתוחה.
לאחר מאבק הסטודנטים להורדת שכר הלימוד, המליצה ועדת וינוגרד להוריד את שכר הלימוד לתואר ראשון ב-50% במשך חמש שנים, כאשר בשנה הראשונה שיעור ההורדה יהיה 14% ובכל שנה נוספת 9% נוספים. יישום המלצות הוועדה החל בשנת הלימודים הנוכחית.