ההסטוריה של אוניברסיטת סן - פרנסיסקו שזורה בהווסדות המסדר הישועי בקליפורניה, הגירת אירופאיים למערב ארצות הברית וגידול אוכלוסיית ארצות הברית ככלל וקליפורניה בפרט בשל הבהלה לזהב. ב- 15 באוקטובר 1855 נוסדה האוניברסיטה. בתחילה היתה כנסיה ישועית ובית ספר ועם הזמן המוסד גדל והגיע להכרה כאוניברסיטה בימינו אנו. כאוניברסיטה קאתולית אורבנית, עם פרספקטיבה גלובלית, משכה האוניברסיטה את מיטב הסטודנטים, הנתמכים על ידי צוות האוניברסיטה, היוצרים אווירה מרגשת ומאתגרת.
כמכון, אנו מחוייבים ללימודים, למחקר ולתלמידינו. התלמידים שלנו, הבאים מכל רחבי ארצות הברית, ומיותר מ-70 מדינות מרחבי העולם והיוצרים אוירה רבת פרספקטיבות המעשירה את עבודתנו האינטלקטואלית לאין שעור. מיקומנו בסן-פרנסיסקו מספק לנו גישה לאחד ממרכזי התרבות הגדולים בעולם ויוצר אפשרויות לימוד רבות ומגוונות.