תכנית הלימודים לתואר שני בהנדסה אזרחית תאפשר לבוגרים/ות מצטיינים / ות בהנדסה אזרחית ובתחומים נושקים להעמיק את הידע בתחום הנדסת מבנים בהתאמה לעידן הדיגיטלי רווי הנתונים, לכלים
חישוביים מתקדמים, לשיטות אופטימיזציה ולמדע הנתונים.
מטרת מסלול הלימודים המחקרי הכולל תזה הנה לחשוף את הלומדים לנושאים מתקדמים בתחום המבנים, על שלל היבטיו, ולאמנם בשיטות מחקר, כולל סקר ביקורתי, ביצוע מחקר והגשת חיבור מדעי. המחקר יהיה עיוני או ניסויי,
יישומי או בסיסי. מי שיבחר בכך, יוכל במסגרת לימודי המוסמך, לפתח יכולת מחקרית ולעלות על הנתיב ללימודי התואר השלישי באקדמיה.
מטרת המסלול הנלמד ללא תזה, הנה לחשוף את הלומדים לנושאים מתקדמים ולהעניק ללומדים ידע נרחב ומעמיק בנושא המבנים על שלל היבטיו ועל שלל יישומיו בתחומים שונים. השתלמות כזו עשויה להוות יתרון עבור בוגרים
השואפים להשתלב בתפקידי מפתח תכנוניים, ביצועיים וניהוליים בחברות ממשלתיות ופרטיות, ולאפשר להם להוביל את הענף כולו אל העתיד תוך שימוש בטכנולוגיות מתקדמות ובפירות המחקר והפיתוח העדכניים בתחום.
במסלול המחקרי הכולל תזה יכללו קורסים בהיקף של 24 נ"ז, כאשר בחירה של חלקם תהיה מוכוונת לנושא המחקר של הסטודנט ותעשה בעזרת המנחה. כתיבת עבודת תזה תזכה את הסטודנט ב 12 נ"ז שישלימו את החובות האקדמיים במסלול עם תזה.
במסלול ללא תזה המטרה היא להעשיר, להעמיק ולהרחיב את הידע של הסטודנט. המסלול יכלול קורסים בהיקף של 30 נ"ז, ופרויקט גמר בהיקף של 6 נ"ז.