מקרא זה למעשה התנ"ך בלשון חז"ל. מטרת הלימודים בתחום זה היא להקנות לתלמידים את ידיעת המקרא והבנתו. ההרצאות והקורסים בתחומים מתמקדים בדרך כלל בנושאים אלו: התנ"ך על כל היבטיו, היסטוריה מקראית וארכיאולוגיה.
בלימודים בתחום מחשבת ישראל זה ניתן למצוא לעיתים קורסים העוסקים בקשר בין דפוסי מחשבה בתרבות היהודית לבין הפילוסופיה.
מחשבת ישראל עוסקת בתחומים השונים של התרבות היהודית לדורותיה: מחשבה, היסטוריה, תרבות ודת.
בין נושאי הלימוד ניתן למצוא: מחשבת חז"ל, פילוסופיה יהודית, קבלה, חסידות, הלכה, תורת הסוד ועוד.