תכנית הלימודים לתואר שני בייעוץ חינוכי M.A , מיועדת להכשיר יועצים חינוכיים מצוינים כך שיתפקדו היטב במסגרות השונות של המערכת החינוכית ויצעידו אותה קדימה.
בוגרי התכנית יהיו בעלי ידע רחב, המבינים היטב את מקצוע הייעוץ החינוכי, המסוגלים לקבל החלטות מנומקות וליישמם ביעילות תוך התחדשות מתמדת ואשר יקדמו את מטרות בית הספר תוך מתן עדיפות גבוהה למיטביות של התלמיד.
הלימודים לתואר שני בייעוץ חינוכי M.A הם החלק הראשון בהכשרת היועצים החינוכיים.
לאחר סיום התכנית ממשיכים הבוגרים - היועצים החינוכיים- את הכשרתם באחריות שפ"י עד להסמכה וקבלת רישיון ייעוץ חינוכי קבוע (התלוי בהערכת עבודתו של היועץ החינוכי על-ידי הייעוץ החינוכי הבכיר בתיאום עם המפקח הכולל).
היועצים החינוכים מחוייבים לתהליכי פיתוח מקצועי מתמשך, בכפוף למדיניות שפ"י ובפיקוח הייעוץ הבכיר. על כן, התכנית הלימודים לייעוץ חינוכי משלבת מרכיבים תיאורטיים אקדמיים ולצד מרכיבים מעשיים והתנסותיים .
היועצים החינוכים מהווים דמות מרכזית בצוות בת הספר. תפקידם למצוא את האיזונים הנכונים בין צרכי התלמידים כיחידים וכקבוצות, צרכי המורה והמורים והמערכת הבית ספרית כשלם.