בצד פעילות ענפה של הוראה ומחקר שוקדת הפקולטה על קידום התודעה הלאומית באשר לים התיכון כמשאב כלכלי, כנכס בעל פוטנציאל מחקרי, ביטחוני ומדיני, כשמורת טבע חשובה וכאתר נופש חשוב לאוכלוסייה בכלל ולענף התיירות בפרט.
לאור חשיבותו של הים התיכון למדינת ישראל הקימה הפקולטה למדעי הים במכמורת את המרכז ללימוד ומחקר של הים התיכון בשיתוף אוניברסיטת תל אביב, הפקולטה לחקלאות של האוניברסיטה העברית בירושלים, מכון וולקני, וכן חוקרים בכירים מהמכון למדעי החיים באוניברסיטה העברית ומהטכניון. מרכז זה יעסוק בים כמשאב (אנרגיה, התפלת מים וחקלאות ימית), יחקור את התוצרים הרבים שאפשר להפיק ממנו, וכן יעמוד על האמצעים שיש לנקוט כדי למנוע נזק ואף לתקן נזקים שנגרמו לים התיכון ולסביבתו מפעילות האדם. מרכז מחקר זה חבר גם למכון הלאומי לחקר הים התיכון בו משתתפים מירב המוסדות האקדמיים בישראל ומנוהל כיום ע”י אוניברסיטת חיפה.
סנונית ראשונה לשיתוף הבין-אקדמי היא תכנית לימודים ייחודית ובין-תחומית שנפתחה לאחרונה: הנדסה מכנית וביוטכנולוגיה ימית. לבוגרי התכנית יוענק תואר בוגר בהנדסה מכנית מאוניברסיטת תל אביב ותואר בוגר בביוטכנולוגיה ימית מהמרכז האקדמי רופין (התכנית המשותפת תימשך חמש שנים בלבד במקום שבע).
ולבסוף, חוויית הלימודים של הסטודנטים בקמפוס מדעי הים ייחודית, מעשירה ומציעה לסטודנטים, בצד לימודי מדע ברמה גבוהה, גם לימודי מקצועות ימיים כמו שיט וצלילה, החיוניים ללימוד ולמחקר הימי.
פעילות ימית:
תכנית הלימודים בפקולטה למדעי הים כוללת לימוד מעשי של מקצועות ים. במסגרת זאת משתתפים הסטודנטים בקורסים לימאות עיונית ומעשית ולומדים להשיט סירה מהירה ויאכטה קטנה. המעוניינים בכך יכולים להמשיך את לימודי הימאות המעשית ולקבל תעודת משיט*.
מועדון שיט:
לרשות הסטודנטים עומד מועדון שיט הממוקם במעגן במכמורת, במתחם בית הספר הימי מבואות ים. המועדון מאפשר לסטודנטים ליטול חלק בפעילויות שיט וספורט ימי ומעמיד לרשותם גלשני רוח, מפרשיות קטנות, סנוניות, יאכטות וקיאקים.
מועדון צלילה:
מועדון הצלילה ממוקם סמוך למועדון השיט ומאושר על פי כל התקנים של הרשות הספורטיבית לצלילה. המועדון מספק ציוד לסטודנטים בקורסים שכוללים צלילה, וכן מציע קורסי צלילה לדרגות 2-1 כוכבים, מדריכי צלילה, ניטרוקס ועוד*. נוסף על אלה, בפקולטה למדעי הים מתקיים קורס צלילה מדעי בינלאומי של אגודת AAUS המקנה לבוגריו תעודת עבודה מדעית מתחת למים, וכן קורס במחקר תת-ימי.
הפלגות:
במסגרת לימודי הימאות המעשית לקבלת תעודת משיט מקומית ובינלאומית, הסטודנטים משתתפים בהפלגות לימודיות אל מחוץ לחופי הארץ. בקיץ שבין שנה א’ לשנה ב’ הסטודנטים מפליגים לקפריסין, ובקיץ שבין שנה ב’ לשנה ג’ – לאיי יוון*.
*ההשתתפות בפעילות ימית הכוללת הפלגות, קורסי צלילה, הסמכה למשיט וכו’ כרוכה בתשלום נוסף שאינו כלול בשכר הלימוד, אך ניתן בהנחה ניכרת לתלמידי הפקולטה למדעי הים.